Gaasiauto mootor töötab samal põhimõttel, mis bensiini- või diiselautogi. Peamiseks erinevuseks on kütus, mida energia saamiseks põletatakse. Sõiduki heitgaaside koostis sõltubki suuresti just kütusest, mida autos kasutatakse.
Kui tavaliselt on selleks vedelal kujul bensiin või diisel, siis surugaasiga sõites on kütuse peamiseks komponendiks metaan ning LPG-ga sõites propaani ja butaani segu. Eesti Gaasi müügijuhi Mario Berki sõnul on bensiini ja CNG sõiduki heitgaasid koostiselt sarnased, kuid erinevad õhku paisatavate ainete hulga poolest.
“CNG auto eeliseks on see, et heitgaase on vähem. CO2 on olulisest vähem, aga need protsendid juba varieeruvad. Üldiselt võib öelda, et CO2, CO, lämmastiku- ja väävliühendeid on kindlasti vähemalt 25% vähem kui bensiiniauto heitgaasis,” sõnas Berk.