Yaris Cross kasutab Toyota 1,5-liitrist hübriidajamit. Kolmesilindrilise Atkinsoni-tsükliga mootori puhul on oluliselt vähendatud hõõrde- ja muid mehaanilisi kadusid ning optimeeritud kütuse põlemiskiirust.
Mootori kasutegur on 40%, ületades sellega tootja sõnul võrreldavate omadustega diiselmootoreid, olles nii kütusesäästlik kui ka väiksema CO2 heitkogusega. Uue hübriidjõuallika tippvõimsus on 116 hobujõudu. Keskmine kütusekulu jääb vahemikku 4,4 – 5,1 l/100 km.
Kohanduv nelikveosüsteem
Yaris Crossi elektriline nelikveo süsteem on mehhaanilisega võrreldes kompaktsem ja kergem, võimaldades seeläbi madalamat kütusekulu ja vähem heitmeid kui ükski teine nelikveoline B-segmendi linnamaastur.